Elle est tributaire des milieux humides. Elle vit au voisinage de l'eau (berges des rivières, ruisseaux, fossés, mares, étangs, lacs) qui présente une végétation abondante. On la rencontre aussi dans les milieux tourbeux, les marais et les prairies humides.

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La musaraigne aquatique est considérée comme vulnérable au niveau régional. C'est une espèce protégée.

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Crossopus musculus Wagler, 1832 | Neomys albiventris (de Sélys Longchamps, 1839) | Neomys albus (Bechstein, 1800) | Neomys amphibius | Neomys aquaticus (Müller, 1776) | Neomys carinatus (Hermann, 1780) | Neomys collaris (Desmarest, 1818) | Neomys constrictus | Neomys daubentonii (Erxleben, 1777) | Neomys eremita (Meyer, 1793) | Neomys fimbriatus (Fitzinger, 1868) | Neomys fluviatilis (Bechstein, 1793) | Neomys griseogularis (Fitzinger, 1868) | Neomys hermanni (Duvernoy, 1835) | Neomys hydrophilus (Pallas, 1811) | Neomys ignotus Fatio, 1905 | Neomys intermedius Brunner, 1952 | Neomys leucotis (de Sélys Longchamps, 1839) | Neomys lineatus (E. Geoffroy, 1811) | Neomys linneana (Gray, 1838) | Neomys liricaudatus (Kerr, 1792) | Neomys longobarda (Sordelli, 1899) | Neomys macrourus (Lehmann, 1822) | Neomys minor Miller, 1901 | Neomys musculus (Wagler, 1832) | Neomys naias Barrett-Hamilton, 1905 | Neomys nanus Lydekker, 1906 | Neomys nigricans (Nilsson, 1845) | Neomys nigripes (Melchior, 1834) | Neomys psilurus (Wagler, 1832) | Neomys remifer (E. Geoffroy, 1811) | Neomys rivalis (Brehm, 1830) | Neomys stagnatilis (Brehm, 1826) | Neomys stresemanni Stein, 1931 | Sorex albiventris de Sélys Longchamps, 1839 | Sorex aquaticus Müller, 1776 | Sorex fodiens albus Bechstein, 1800